Le opzioni di base sono le stesse in tutte le recovery, si può flashare una ROM dalla microSD oppure dalla memoria interna ("internal SD").
Per la compatibilità non saprei dirti, io finora ho installato la CM 10 (l'ultima versione che ho messo è la Jellybro aggiornata all' 11 agosto), che funzionava con tutte e 3 le recovery, ora sto comunque con la ROM stock