C'è l'opzione 'Salva configurazione home' e quindi ripristina in MyBackup Pro, però se cambi rom cambia spesso anche la struttura della home, quindi fa più casini che altro. Tra l'altro MyBackup salva anche contatti, sms, mms ecc...
Se invece vuoi ripristinare la stessa rom, è meglio fare un bel nandroid backup quando ti sembra che vada tutto bene e nel caso lo ripristini quando hai fatto qualche casino.