Problema (credo) ad ogni wipe....

Ciao a tutti!
Allora, il dubbio che mi assale è il seguente!
Ogni volta che voglio cambiare rom in maniera "profonda" faccio un bel wipe. Naturalmente ho un backup di tutte le mie applicazioni (installate originariamente dal market) fatto con mybackup pro.
Nel momento in cui vado a ripristinarle pero' succede che andando nel market queste non risultano essere installate e quindi non ne ricevo gli aggiornamenti automatici dal market stesso.
Per ovviare le reinstallo una ad una andando a sostituire quelle ripristinate dal backup (anche se poi logicamente si tratta della stessa versioine).

Come si puo' ovviare a tutto questo?
Grazie mille