Backup parzialmente fallito?

Ciao a tutti.
Meizu M3 Note mod: L681H, con Android 5.1 e aggiornato alla Flyme 6.3.0.0G; questo è il telefono di mia moglie.
Qualche giorno fa abbiamo fatto il passaggio a ILIAD e siccome non riuscivo a fargli prendere il nuovo APN, mi è stato consigliato di fare un hard-reset; quindi ho fatto il backup completo sulla SD da 30 GB e poi il reset.
Finalmente ho configurato la SIM (l'APN è andato bene) e ho fatto il ripristino del backup. Tutto sembrava avere funzionato a dovere: c'erano tutti i contatti e quasi tutte le app (eccetto alcune che, pur essendoci l'icona, non funzionavano e le ho dovute reinstallare, ma senza troppa pena).
Il problema grande c'è stato con whatsApp. A un primo veloce controllo sembrava esserci tutto: conversazioni, Immagini video ecc. Ma dopo qualche giorno mia moglie si è accorta che molte foto mancavano e anche messaggi vacali e video. Provando a tappare più volte sul quadretto vuoto in alcuni casi veniva recuperata l'immagine o il video, in altri casi no.
Cosa ho sbagliato? Come posso (se è possibile) rimediare?
Grazie per le eventuali risposte.