installazione pulita varie rom

[iGuich]

quindi posso fare anche il format system senza problemi?

Esattamente.
In realtà, per fare una cosa stra pulita, basterebbe mettere la TWRP e fare il wipe principale che da come predefinito.
E poi flashare la rom.
Se invece si vuole formattare anche la sd, la questione è identica con il più del wipe della sd.
Per altre domande, scrivere qui.