Allora,non confondiamoci!!..la sincronizzazione la fa poi il market,una volta che tu hai già installato le gapps e hai configurato l'account..la sincronizzazione ripristina le app che avevi scaricato prima dal market sul cellulare..essendo che tu per usare il market devi inserire l'email,ogni volta che poi scarichi un'app viene aggiornato una sorta di registro messo a nome della tua email..
per quanto riguarda le google app ovvero le gapps,se una volta flashata la rom non ti fa fare la configurazione,o meglio,te la fa fare,ma non ti spuntano market,youtube,etc..allora installi il pacchetto gapps.zip dalla Recovery e poi rieffettui la configurazione..
io personalmente non ho dovuto installare il pacchetto a parte,ma visto che all'altro utente non le riconosceva installate,ho aggiornato la guida,aggiungendo il pazzhetto delle gapps per chi avesse lo stesso problema..:)
spero di essere stato chiaro :)