Un backup, quando si affronta una situazione come nel tuo caso, non dovrebbe mai contenere la parte dati, si dovrebbe limitare solo alle applicazioni ed ai dati personali, ad esempio se usi titanium, in fase di ripristino dovresti flaggare l'opzione "ripristina solo le applicazioni" e non applicazioni+dati utente, altrimenti rischi di ripristinare anche i problemi che hai adesso.
Per rubrica, calendario e quant'altro, basta che sincronizzi con il tuo account gmail e ti ritroverai tutti i tuoi dati.
Sicuramente è una strada più lunga ma è l'unica che ti garantisce un sistema stabile, successivamente con i prossimi aggiornamenti della blumak2000, potrai flashare senza fare alcun wipe ma ora che ti trovi con un sistema un po' ibrido tra una stock ed una custom, per me, dovresti procedere come ho scritto sopra.