In parole povere le rom custom le trovi deodex in quanto più facile modificare successivamente le app (temarle) perché tutte in un solo file appunto apk mentre le odex se volessi temarle dovresti modifcare prima apk poi il file odex con relativi collegamenti. Le rom odex sono più veloci al primo boot perché creano la cache dalvik più rapidamente ma con le deodex dopo il primo avvio la differenza non la noti salvo che non viene fatto il wipe dalvik