Nessuna controindicazione Con il root qualsiasi app può essere spostata nella sd.
Link2sd ti offre anche la possibilità di installarla nella memoria /system/app (ovviamente potresti incontrare dei problemi tipo crash improvvisi)
App2sd invece fa proprio il suo compito di spostare solo le app...
Io ti consiglio link2sd che funziona benissimo e non causa nessun problema.