Te l'ho chiesto perché io trafficando di modding ho avuto ad un certo punto problemi simili. Ho risolto seguendo il consiglio di riportare il kernel a stock e tu ci sei e fare un format dati che ti "pialla" (occhio. ..) anche la SD interna...
A me accadeva che certi contenuti divenivano invisibili pur essendo presenti e altre anomalie strane di questo tipo