se in /system c'è allora s'è corrotta qualche impostazione in /data l'unico metodo per risolverlo è fare un wipe
oppure si può spostare momentaneamente le app da /system alla sd riavviare e poi tornare sulla sd e installare le app (questa se non va a buon fine è un problema però...spariscono e se per caso non le lascia reinstallare devi riflashare la rom)