giusto per capire
hai aperto lo zip della miui e hai sostituito quei file oppure hai fatto il contrario ?
cioè, prendi lo zip della MIUI, lo apri e ci copi dentro i file che ti avevo detto sostituendoli a quelli già presenti (e ovviamente il boot.img rifatto con il tuo zImage).
lo script di flash è già giusto quello che c'è nella MIUI