Infatti ho dovuto fare così. Ho installato la TWRP da PC tramite FastBoot, fatto full wipe e installato la MIUI 8.7.1.20 basata su KitKat (prima avevo la Lollypop).
Finalmente il telefono ha ricominciato a funzionare come deve, inoltre mi pare abbia una gestione dei consumi migliore, arrivo a 24h di utilizzo prima di doverlo mettere in carica.
Ho visto che non c'è più la funzione "permessi di root" nell'app "sicurezza", ma ho visto che è normale. Se mai mi serviranno i permessi di root vedrò d installare super su.