icona scomparsa su rom "cucinata"

Ciao a tutti,
rieccomi alle prese con la modifica di un firmware.....
Devo modificare alcune stringhe tradotte malissimo su un clone cinese, e queste sono contenute nel file settings.apk . Il produttore mi ha fornito il file update.zip quindi le modifiche le sto facendo lì.
Ho preso il file settings.apk e il corrispondente .odex e ho fatto il deodex, dopodichè ho scompattato il file con apktool, ho fatto le modifiche, e sempre con apktool ho riassemblato il tutto, poi ho signato e zipaligned l'apk e l'ho reinserito nel file update.zip cancellando anche il file .odex e poi ho di nuovo signato tutto il file update.zip.
Ho caricato il firmware modificato e sembrava tutto ok, ma se faccio un reset non mi spunta più l'icona delle impostazioni, ma un'altra icona duplicata dell'applicazione "youtube".
Per ora ho risolto mettendo il file resources.arsc modificato nell'apk originale.
Sembrerebbe che dopo la modifica dell'applicazione, il sistema non riesca a generare il file .dex nella cache e quindi blocchi l'applicazione stessa, oppure si tratta di un qualche problema nel "riassemblaggio" dell'apk con apktools.......
Qualche consiglio?

Una considerazione: forse inizialmente il tutto aveva funzionato perchè mi ero dimenticato di cancellare la cache che quindi ancora conteneva i files .dex . Una volta fatto il reset questi si sono cancellati e non vengono più "rigenerati" all'avvio dall'applicazione deodexizzata.........?