Superuser non c'entra niente. Tu hai il root fatto con superuser , il root puoi farlo in molti modi. il root modifica i file di sistema e quando via OTA il sistema prova ad aggiornarsi trova i file modificati e va in conflitto con il rischio molto frequente di mandare il telefono in brick. Sei stato fortunato che non ti sia successo....Dovrai installare il nuovo firmware necessariamente via flashtool o, in alternativa, togliere il root ( cosa sempre complicata...)