Non è così: i file non sono vuoti, ma se non sei root non hai i permessi di lettura e non vedi nulla (mea culpa, sono stato troppo restrittivo) I files .bak li ho lasciati per confronto tra le mie modifiche e l'originale.
Prova ad impostare i permessi di lettura a tutti e due i files con root explorer 644 al posto di 600 attuale: così dovresti visualizzare il contenuto del file