Sisi, i programmi che cancelli con root explorer verranno cancellati per "sempre". Per i file di installazione, dopo averli installati o flashati li puoi cancellare benissimo ;)
Visualizzazione stampabile
Ho flashato da recovery un tema, ma non ho fatto i wipe, ma è tutto ok...non vorrei aver fatto male però... :S
Ad ogni flashche si effettua è consigliatissimo eseguire i due wipe classici, ovvero wipe cache e dalvik, se poi funziona lo stesso come hai fatto te bene, se il telefonoti si brikka o va in FC non chiedere neanche a cosa è dovuto che sai già qual'è il motivo...:p