Il menù delle applicazioni è il menù "tutte le applicazioni", per cui rimane così, ma di norma non si dovrebbe usare per cercare i programmi di uso comune, altrimenti le varie schermate della home a che servirebbero ?
Puoi comunque ottenere il tuo risultato, dato che FolderOrganizer permette anche di fare cartelle dentro alle cartelle, per cui potresti avere una sola cartella in home, che si chiama "applicazioni", e dentro avere le cartelle giochi, internet, multimedia, ecc...
Io ne uso anche una associata a nessuna categoria, chiamata "nuovi", dove ci finiscono tutti i programmi appena installati e ai quali non ho ancora assegnato una categoria.
Pressione lunga sulle icone, e appare il menu per assegnargli la categoria, e altre cose comode, come la disinstallazione, per esempio. Tutte cose che dal menu applicazioni non puoi fare.