Se l'installazione va a buon fine allora funzioneranno perfettamente anche i moduli di personalizzazione UI. Cambiando la linea nel build.prop stai praticamente andando a disattivare il theme engine di huawei (quindi i temi non saranno più utilizzabili). Col mio vecchio Ascend funzionava, è da vedere se funzionerà anche con Honor 6.
Altrimenti c'era un'opzione nelle impostazioni di Xposed che permetteva di disattivare le API, e quindi di usare il framework senza disabilitare il theme engine Huawei, al costo però di avere poca compatibilità con i moduli di personalizzazione grafica. Non so se questa opzione è rimasta anche nelle ultime versioni di Xposed.