Si, puoi flasharlo tranquillamente anche dopo. Purché su froyo (2.2.x)
Ti consiglio di prenderlo dal sito ufficiale. C'è pure la guida illustrata (link in firma)
L'unico rischio è che ti resetti il touchwiz (widget e drawer), soprattutto se attivi il root del telefono (mio consiglio: ROOT, seconda opzione "adv")
Qualcuno ha lamentato un wipe dei dati, ma se stai attento a ciò che tocchi non credo avvenga.
Più che altro per questo si consiglia di installare il kernel a fw vergine... ma non è mandatorio.