Ciao ti ho fatto qualche googlata, ho qualche info..
Se hai il certificato *.CER dovrebbe essere in formato PEM-encoded (X509), quindi un certificato in formato testuale (prova ad aprirlo con notepad e vedi se e' testo) per cui se e' cosi' fai queste prove in sequenza:
1) hai provato ad aprire un file manager e fare doppio click sul file CER per vedere se te lo importa comunque?
2) hai provato a cambiare l'estensione da CER a CRT, metterlo nella SD e verificare se te lo riconosce?
3) In alternativa prova a dare un'occhiata a questo e vedi se ti funziona:
Main - RealmB's Android Certificate Installer
Facci sapere, ciao!