Per usare un altro formato puoi ricorrere a un programma per il partizionamento e la formattazione (es. "Mini Tool Partition Wizard"):
Ma a parte questo, non hai specificato se l'hard disk ha la sua alimentazione o se usa quella della porta USB: nel secondo caso il Nexus potrebbe non riuscire ad alimentarlo a sufficienza.
Io ho un hard disk da 2,5 alimentato dal cavo USB: sul mio Asus Transformer funziona, sul Nexus 7 no, e avvicinando l'orecchio si sente chiaramente che il piattello ha difficoltà a girare, per cui nel mio caso (non so nel tuo) è un problema di alimentazione