Facendo quasiasi tipo di mofica alla rom( ripristino aggiornamento o customizzazione) si ha una cancellazione totale delle varie memorie ed una scrittura nuova dei file aggiornati.
Conclusione: perdi tutte le app e le impostazioni, per i salvataggi se sono situati sulla sd basta rimuoverla durante l'upgrade ed installare nuovamente le app dovrebbero ripristinarsi.