È molto che non uso ES ma in passato mi ha dato diverse volte problemi con i permessi di root anche solo per sostituire una bootanimation. Riprova usando rootexplore che è a pagamento (si trova facilmente) oppure con solid explorer se non l'hai mai usato per 15 giorni è gratis (io l'ho comprato va benissimo). O comunque un altro gestore di file root