Alegu ti consigliava di provare la nuova rom come secondaria solo perchè se qualcosa va storto non rischi di perdere eventuali dati archiviati nella memoria del tuo telefono e di non dover reinstallare tutto da capo.
Ovviamente puoi sempre installare direttamente la nuova come primaria (ti consiglio cmq di farti un nandroid backup da recovery), dovresti praticamente reinstallarti tutto da zero, apps e configurazioni varie. Per eventuali file musicali, foto o altro, puoi copiartele sul pc e ritrasferirle appena hai finito l'installazione.
Il bootloop si verifica quando un'installazione di una rom non è andata proprio a buon fine, rimanendo sempre nella schermata di avvio, quella con il logo praticamente. Anche riavviando il terminale, il telefono rimane sempre li e non carica il sistema operativo.
Spero di essere stato chiaro e di aver inteso bene il pensiero di Alegu.