Secondo me dovresti provare ad installare Setcpu: io con il kernel originale avevo il tuo stesso problema. Ho fatto caso che si presentava soprattutto dopo un pò che lo schermo si era spento (non so se è così anche per te). Ho fatto dei tentativi e ho scoperto che se impostavo il profilo per lo screen off con freq.min. e max = 500Mhz, questo non succedeva più. Ciò mi capitava anche i primi tempi con le rom stock e facendo questo il problema si risolveva. Ciò è dovuto al fatto che quando lo schermo è spento nello scalare le frequenze esse passano un pò di tempo per i 200Mhz, ma non tutti i cell riescono a sopportare la frequenza così bassa.