Allora:
Sono partito da una situazione pulita:
Ho formattato la Memoria USB, la SD e ho fatto un wipe data/factory reset della memoria interna del cellulare.
In recovery ho attaccato il cell al pc, ho fatto un mount della memoria usb e ci ho copiato dentro la rom, il kernel 2.4 e il reboot.zip (per il menù riavvio a 4 voci).
Ho installato nell' ordine: Rom, Reboot.zip e Kernel quindi ho Riavviato.
Ho configurato il cell con l'account gmail e sincronizzato, ho scaricato qualche programma dal market e in ultimo ho scaricato 5 temi dai Temi Online dell'applicazione temi. Dopo averli scaricati li ho applicati, naturalmente uno ad uno per vedere se venivano messi, e nessun problema: i temi vengono applicati normalmente e tornati al desktop si vede subito il nuovo tema.
Ti consiglio, quindi, di partire anche te da una situazione pulita... (NON ESEGUIRE ripristini, specialmente di impostazioni)