Il caricabatterie dell's2 arriva a 700mha (anche se selezioni 1100 carica al Max a 700). Dunque,considerando la batteria di un s3,la carica dovrebbe completarsi in 3,5 ore.
Se proprio vuoi capire se dipende dal kernel, prova a cambiarlo con quello stock o col googy.
Anche se questo problema della carica si è accentuato parecchio con le ROM 4.3