Io farei così: leva la sd come ti ha consigliato mkel, per un paio di giorni non la inserire proprio.
Recovery cwm: wipe cache, data, davilk. Flasha con odin la MB4 con i 3 file (pit, csc, pda). Fagli fare un riavvio e poi flasha la MF1 (attualmente sto usando questa come base e va). A questo punto installa una cyano e non eliminare i file che di solito togli (eviterei anche i beats audio driver per ora). Usala per 2-3 giorni così e vedi se si ripresenta il problema. Se funziona tutto rimetti la sd (magari falla formattare al cell) e pian piano rifai le varie modifiche..
Ho notato che quando passo da una cm ad una stock devo flashare per forza prima la mb4, altrimenti mi va in bootloop.