Non ho capito moltissimo, comunque una cosa è certa, copiando in una cartella nuova del pc il contenuto della tua SD non ti copia di certo le varie app. Per riottenere le varie app dopo una formattazione devi fare prima un backup. (ti consiglio questo https://play.google.com/store/apps/d...TXlCYWNrdXAiXQ..)
Comunque 16 GB di scheda SD bastano e avanzano!