Con un po' di ritardo perchè ho dovuto smontare nuovamente il telefono ma ho eseguito il backup della scheda madre vecchia e l'ho caricato sulla nuova ma il codice IMEI resta sempre quello nuovo.
Ho controllato però che nella cartella efs non è presente il file nv_data.bin mentre nv_data.bin.md5 c'era, l'ho cancellato e riavviato il telefono. Non l'ha ricreato. A questo punto mancano entrambi ma l'IMEI è sempre quello della scheda nuova...