esatto da recovery si flashano solo file zip, le app che non scarichi dal play store, le avrai in formato .apk e le installerai semplicemente con un app tipo "archivio".
Per aggiornare la rom o installarne di nuove è necessario flashare il relativo zip dalla recovery, per farlo segui questa guida
In alcuni casi non è necessaria la "pulizia" quindi non viene cancellato nulla dal tablet