Prova a fare i wipe del telefono, perchè durante i flash a volte queste cose accadono...
Come si fa?! Entri in recovery (vol+ home e accendi) e selezioni wipe data e wipe cache ed eventuali wipe che la recovery riporta...io sono solito farli un paio di volte prima di riaccendere il telefono per essere sicuro che li abbia fatti tutti...purtroppo perderai tutti i dati sensibili quali sms, rubrica, applicazioni, dati applicazioni e simili...
Per salvare questi dati puoi utilizzare programmi appositi quali "titanium backup" o simili!
Buon lavoro!!