Il root senza usb debugging non puoi farlo.
La questione è: perchè hai root-ato se non lo usi? Come detto in precedenza l'operazione di rooting ti espone a gravi rischi se non utilizzato con cognizione di causa.
Non succede nulla ma stai attento.
La seconda: il rooting serve per andare (semplificando) nei meandri nascosti del sistema operativo, normalmente esclusi perchè, se intaccati, si compromette il funzionamento del mezzo.
Un consiglio: esci dal root. Anche io non lo uso (se non quando applico programmi particolari).