uhmmm.... no, generalmente qualunque applicazione o gioco e' in file .apk, controlla se, all'interno degli zip, c'e' il solo apk.
Per i temi idem. Diciamo che, kernel, radio, rom, gapps a parte (che sono tutti .zip da flashare come hai fatto fin'ora), TUTTO il resto e' .apk.
Per installarli ti basta copiarli nella SD (io, ad esempio, mi sono creato una cartella chiamndola APK), copiarci i files, poi, con l'applicazione per gestire la sd, spesso c'e' gia' di default nella rom che installi, ma puo' essere AndroZip, come OI, come chissa' cos'altro, vai all'interno della sd, nella cartella scelta, selezioni l'apk e parte l'installazione.