Anche a me capita su S2 da quando ho rimosso SD card... ho provato a disinstallare e reinstallare, ma niente da fare.
Ho provato a rimettere una nuova SD Card e niente da fare.
Alla fine ho fatto così:
Ho lasciato dentro la nuova SD Card
Sono andato su Gestione Applicazioni e su SwiftKey
Ho cliccato "cancella dati"
Ho cliccato "disinstalla applicazione"
Ho riavviato
Ho reinstallato Swiftkey dal PlayStore
Ho rifatto l'accesso con Google
Ora funziona e quando riavvio non mi appare più il messaggio!
Problema risolto, spero di essere d'aiuto a chi avesse lo stesso problema :-)