Innanzitutto la partizione deve essere in ext4, poi link2sd non fa nulla in automatico, ma devi essere tu a creare i collegamenti per ogni applicazione...nulla di quello che scrivi deve avvenire così come non avviene a te:)
Tu avrai ancora la partizione telefono dove installare le app cioè quella da 100 150 mb, la memoria interna da un gb dove potevi già spostare le app e mettere i dati e poi la memoria della sd!
Nella memoria delle sd, avrai una parte dove mettere i dati cioè quella che hai formattato in fat32, ed una parte dove linkare le applicazioni tramite link2sd cioè la partizione in ext4 e che ti vede solo il programma! Se hai fatto tre partizioni, la partizione più piccola, serve solamente per gestire le altre due!
Fai le 3 partizioni, scarichi link2sd dal market, lo apri e selezioni la partizione ext4, dopo ti fara riavviare il telefono, dopo aver riavviato cliccli l'applicazione che vuoi spostare e fai crea collegamento e colleghi tutto!;)