La cartella TWRP viene creata la prima volta che si accede alla recovery e poi se la si cancella viene ricreata all'accesso successivo...
Se non ce l'hai più non è un problema perché viene ricreata...il problema è che hai perso tutti i backup che avevi dentro...
Dovete fare attenzione ad usare APP che fanno la pulizia memoria, come anche Power manager...se fate la pulizia da lì vi cancella la directory TWRP con tutto quanto c'è dentro...
Comunque puoi tranquillamente procedere all'installazione della 3.0