Keep calm and no panic!
Allora. Iniziamo con il dire che è altamente sconsigliabile effettuare aggiornamenti OTA o tramite il tool ufficiale in presenza di root e recovery. Da quel che capisco dalla tua descrizione, il tentativo di aggiornamento ti ha formattato il file system ma non ti ha installato quello nuovo, lasciandoti di fatto senza file system. Detto questo, fai così: scaricati una qualunque ROM da QUI, mettila nella SD EXT e flashala da recovery. In questo modo avrai ripristinato la piena funzionalità del terminale e poi potremo proceder con l'aggiornamento.