Per chi come me avesse riscontrato problemi con l'aggiornamento alla versione 3.0 di Superuser, segnalo che è presente nel market "superuser update fixer".
I problemi da me riscontrati erano la ridondanza nella richiesta da parte dell'applicazione di aggiornare il binario, in quanto appunto non riusciva ad aggiornarlo e, ben più noiosa, l'impossibilità di salvare la preferenza nella concessione dei permessi per alcune app. In applicazioni come "mybackup" ad esempio ci si vedeva costretti a concedere i permessi di root per ogni app da backuppare.