Con il profilo prestazioni le CPU non restano sempre alla massima frequenza, la differenza principale rispetto al profilo bilanciato è che lo scalo dalle alte frequenze a quelle più basse è un po' meno aggressivo, per il resto si equivalgono. Ad ogni modo la risposta è no, non crea problemi, ma teoricamente i consumi dovrebbero essere un po' più elevati.
Non dovrebbe, la procedura "standard" per l'aggiornamento da CM13 a versione più recente è quella che trovi al primo post. Da quando uso questa ROM non ho mai avuto problemi a fare l'aggiornamento "dirty", cioè sporco, con i soli wipe cache e dalvik/ART cache. Se magari a lungo andare noti ad esempio dei lag che prima non avevi e non imputabili ad una nuova Nightly (il thread resta a tua disposizione anche per il confronto con gli altri utenti riguardo il comportamento delle build più recenti), allora puoi considerare una installazione pulita con full wipe![]()