allora alla fine avevo risolto riflasshando tutto.
Ho fatto backup, fatto tutti i wipe, installato la rom, installato le gapp. Dopo il primo avvio ho flashato anche il file swap suggerito nella guida e tutto è andato bene per due giorni.
Il problema si è ripresentato quando ho lasciato scaricare completamente la batteria e il telefono si è spento.
Dopo la carica e riavvio la memoria esterna non era di nuovo più raggiungibile...quindi succede qualcosa di strano in quella fase, fin quando l'ho tenuto carico è sempre funzionato.