Secondo me il problema potrebbe dipendere dal kernel e non dalla MIUI. Ho provato sul mio Feiteng H9500 con MIUI 3.11.22 e il problema non si è manifestato.
Questo è ciò che ho fatto:
Impostata sveglia alla 11:12 e power up alle 11:08
Spento cellulare (ore 11:06)
Alle ore 11:08 si accende il terminale e alle 11:12 suona la sveglia
Faccio suonare per circa 15 secondi dopodichè silenzio la sveglia tramite scorrimento
Il terminale mostra la schermata Home, dopo qualche minuto entra in standby
Attendo circa 5 minuti e poi dal terminale invio una chiamata che viene effettuata regolarmente (faccio solo suonare senza rispondere)
Attendo altri 5 minuti e invio una chiamata al terminale che viene tranquillamente ricevuta
Credo che, se il bug fosse nella MIUI, doveva manifestarsi anche nel mio terminale.
Una nota: mi sono accorto di aver fatto il tutto con la suoneria disattivata ma non dovrebbe centrarci nulla.