Prova a cambiare anche il governor della CPU con uno più conservativo, o abbassa la frequenza massima dei core (da quanto ho capito hai il root).
Non voglio mandarti sfiga, ma a patto di non aver moddato eccessivamente (overclock, telefono che non entra in deep sleep) l'eccessivo riscaldamento è cattivo presagio di un malfunzionamento hardware