Vabbè "gran fregatura"...ora non lo so perchè a te fa così ma a me in deep sleep ci è sempre andato, ragion per cui l'unico modo per vedere se risolvi, visto che non è un problema che hanno tutti, è fare un bel reset totale, e al limite riflashi pure rom e gapps e vedi se risolvi, sennò non saprei proprio quale può esse il motivo!
Inoltre con titanium backup ti fai un backup delle app scaricate che vuoi recuperare, in fondo non è tutta sta disgrazia!
Inoltre se fai il backup delle impostazioni di Apex recuperi anche quelli, ma salvali sulla sd esterna.
Ma poi fammi capire, dopo la prova che ti ho detto di fare quali frequenze hanno lavorato?
Rifaresti la prova e posti lo screen shot???