Installando una Rom con il metodo DLOAD (quindi qualsiasi Rom ufficiale come questa) si cancella anche la sd interna, dove c'è la cartella whatsapp ed il relativo backup dei messagggi, di conseguenza non li puoi ripristinare dall'app stessa in quanto persi.
Il fatto che tu li abbia su Gmail è strano, a me non è mai successo...come potresti ripristinarli avendone copia su gmail proprio non ne ho idea.