Questo mi fa pensare più ad un qualche problema generato da un applicazione che succhiava troppe risorse oppure a qualche "widget" impostato per accedere ad internet troppo frequentemente per fare delle operazioni, lettura mail e così via, in quel modo magari non andava mai in "Deep Sleep" e rimaneva l'applicazione stressando il processore all'infinito.
Dopo aver ripristinato hai rimosso qualche applicazione ? O hai cambiato qualche configurazione di operazioni ripetitive ?