Dal momento in cui flashi la recoveryMod non devi riavviare a sistema.. ma entrarci subito e flashare il SuperSu 0.99
Visto che ci sei scaricati dal thread CWM l'ultima 6.0.2.8 , così in sequenza appena entri in recovery fai:
Flash della recovery > riavvia in Recovery stesso dal menu avanzato > Flash del SuperSu