Il wipe data da recovery in realtà pulisce molto più che le sole app. Formatta tutta la partizione /data, che è piuttosto estesa. In questa partizione abbiamo tutti i dati utente, quindi si le app, ma anche le varie sincronizzazioni, account, ecc.
Per quanto riguarda il wipe da impostazioni, è un factory reset. Esso comprende wipe data, wipe cache, wipe dalvik cache ed anche il wipe sdcard (quindi la pulizia della memoria di massa, dove hai foto, video, musica, ecc ecc).