... comunque ho avuto i tuoi stessi problemi su HOS con Root su ROM Stock !!
pare che anche per il ONE M8 è la stessa cosa ... ho visto che esiste una MOD
"wp_mod: Module to disable system write protection"
ossia un modulo che consente di "Disabilitare la protezione di scrittura in System" !
credo che sia questa la causa che impedisce, anche con il root, di eseguire determinate operazioni ...
come risolvere non so dirti !
magari tenta con questa vecchia versione di SuperSU
e prova se risolvi prima di aggiornalo ...